因为都是在入境时候有海关检查的，跟你从哪里过去的关系不大。
通行证是中国大陆地区居民往来中国台湾地区所持有的证件一般与入台证一起检查。
《中华人民共和国公民出境入境管理法》第五条：中国公民因私事出境，向户口所在地的市、县公安机关提出申请，除本法第八条规定的情形外，都可以得到批准。公安机关对中国公民因私事出境的申请，应当在规定的时间内作出批准或者不批准的决定，通知申请人。第六条：中国公民因公务出境，由派遣部门向外交部或者外交部授权的地方外事部门申请办理出境证件。
1、去台湾要办两个证《大陆居民往来台湾通行证》《个人游入台许可证》。
2、办理《大陆居民往来台湾通行证》：申请人自行前往本市公安局出入境管理处办理【大陆居民往来台湾通行证】及个人旅游签证（建议出行前15个工作日开始办理；符合异地办理通行证条件者建议提前25个工作日办理）。办理证件时需要携带：本人身份证原件、户口本原件，同时需要填写《大陆居民往来台湾地区申请审批表》。
3、如申请人是《审批表》背面列数的工作单位职员，须出具单位意见，负责人签名并加盖公章。表格右上角的照片请于公安局出入境管理处指定拍摄的照相馆拍照。办理好通行证请于指定日期内交至为您办理入台证的旅行社，以便后续操作。申请人携带复印件：身份证复印件（正反2面清晰复印在一张A4纸上），户口本复印件一份（户口本首页和本人页）。
4、办理《个人游入台许可证》请至户籍所在地有资质旅行社办理台湾入台证，应备资料如下：申请书(照片不必贴在申请书上，所有资料必须填写详细，不能空白)。照片(白底2吋清析照片)，与申请书分开给。申请人身分证正，反二面都要。大通证照片页及G签，大陆居民赴台个人游。申请人户全户户口卡(空白页不需要)。
5、财力证明：存款证明(必须人民币五万元以上，重点是开立日期必须于送件日当天开始算起，往前推一个月或一个月以上的日期)，公司在职证明(必须使用公司正式纸张填写。重要是必须填写职位，年薪15万人民币RMB以上的证明，公司章戳必须清晰，且必须写清币种、开具日期)。
6、中国大陆所发之金卡(一定要金卡或白金卡)，正面必须要有申请人之英文姓名，反面必须要有申请人之亲笔签名。紧急联络人(必须在同一户口上之直系血亲，如果不在同一户口上，必须开立公安关系证明)，或是组团社经理级以上人员也可以做为担保人(但必须要附上身分证正，反二面，表格，在职证明，)联络人表格签名栏，一定要手写，联络人之身分证正，反面，户口卡一定要，联络人必须年满20岁以上。
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法律分析：
往来台湾通行证有效期分为10年和5年两种：有效期为10年的往来台湾通行证签发给已满16周岁的大陆居民，有效期为5年的往来台湾通行证签发给未满16周岁的大陆居民。
法律依据：
《大陆公民往来台湾地区管理办法》
第二十二条大陆居民往来台湾的旅行证件系指大陆居民往来台湾通行证和其他有效旅行证件。
第二十三条台湾居民来往大陆的旅行证件系指台湾居民来往大陆通行证和其他有效旅行证件。
第二十四条大陆居民往来台湾通行证有效期为10年；台湾居民来往大陆通行证分为5年有效和3个月一次有效两种
